Inspektorat Daerah Kabupaten Wakatobi sebagai Aparat Pengawas Internal Pemerintah (APIP) Kabupaten dalam upaya mewujudkan tata kelola pemerintahan yang baik, bersih dan berwibawa guna mewujudkanVisi kabupaten Wakatobi sebagaimana yang tertuang dalam RPJMD Kabupaten Wakatobi Tahun 2021-2026, yaitu ”Mewujudkan Kabupaten Konservasi Maritim Yang Sentosa” Hal ini sejalan pula dengan tugas untuk melaksanakan penyelenggaraan pemerintahan yang bersih dan merupakan persyaratan guna mewujudkan aspirasi masyarakat dalam pencapaian tujuan berbangsa bernegara. Good Governance merupakan suatu system pengelolaan pemerintah yang didasarkan pada prinsip transparansi, partisipasi dan akuntabel. Untuk mewujudkan tata pemerintahan yang bersih dan berwibawa setiap bagian dalam organisasi pemerintahan harus dapat menyajikan kinerja yang dapat diukur dan dinilai oleh segenap komponen masyarakat yang bersifat transparan, dapat dipertanggung jawabkan, efektif dan efisien.